После обнуления чипа и установки в принтер повторно заправленного картриджа чип будет считать расход чернил, или после обнуления эту способность теряет и я буду узнавать о том, что ченила закончились только по факту их окончания ?

Если картридж заправлен грамотно и полностью - будешь видеть практически реальный уровень чернил.
И уменьшаться уровень будет так же, как и в оригинальном картридже. Для того и существует программатор.